Servicio de Administración de Sistemas y Bioinformática

A continuación se detallan las funciones principales del Servicio de Administración de Sistemas y Bioinformática:

1. Formación en análisis bioinformáticos y desarrollo de recursos de aprendizaje:

• Realizar formaciones personalizadas, cursos y seminarios sobre análisis de datos, herramientas bioinformáticas y mejores prácticas en la gestión de datos biológicos.
• Facilitar que los investigadores del centro estén al tanto de las últimas tendencias y tecnologías en el campo de los análisis ómicos.
• Compartir recursos de aprendizaje propios, junto a tutoriales, documentación técnica y foros en línea, promoviendo una comunidad activa en bioinformática en el centro.
• Evaluar la efectividad de las formaciones mediante encuestas y retroalimentación, ajustando el programa para mantenerlo relevante y alineado con las necesidades de los investigadores.

2. Asesoramiento en el desarrollo de análisis ómicos:

• Colaborar con equipos multidisciplinares en la planificación y el diseño de experimentos relacionados con análisis ómicos, maximizando la viabilidad técnica.
• Ofrecer orientación sobre las mejores prácticas en el manejo y análisis de datos ómicos, adaptando los enfoques según el contexto específico de cada proyecto.

3. Soporte computacional especializado en bioinformática:

• Gestionar la instalación, configuración y actualización de software específico para el procesamiento de datos biológicos en los equipos asociados al servicio, procurando la compatibilidad y funcionalidad óptima.
• Ofrecer apoyo técnico especializado en el uso de nuestras herramientas y software bioinformático, asistiendo en la resolución de problemas relacionados con el procesamiento de datos biológicos.
• Colaborar con los investigadores para identificar y evaluar nuevas herramientas y tecnologías, y promover la integración y ampliación de las capacidades analíticas en nuestros sistemas.

4. Asistencia técnica para el uso de los sistemas asociados al servicio:

• Organizar sesiones de capacitación y talleres prácticos para los usuarios, con el fin de mejorar su competencia en el uso de las herramientas informáticas y maximizar su productividad.
• Proporcionar soporte técnico a los usuarios en el uso de sistemas asociados al servicio.
• Desarrollar manuales de usuario y protocolos de operación claros para facilitar el uso eficiente de las herramientas y recursos disponibles.

5. Administración y gestión estratégica de la infraestructura informática común:

• Supervisar, evaluar y gestionar de forma activa la infraestructura informática común, priorizando su operatividad y seguridad.
• Evaluar y optimizar el rendimiento de los servidores, las redes y los sistemas de almacenamiento vinculados al servicio.
• Implementar y actualizar periódicamente políticas de seguridad y protocolos de respaldo de datos para asegurar la protección integral de la información sensible.
• Auditar regularmente que todas las herramientas y plataformas cumplen con las normativas de uso y licencias correspondientes.
• Identificar proactivamente las necesidades actuales y futuras del centro en términos de infraestructura informática, contratos de soporte y licencias, con el objetivo de fomentar la renovación, asegurar la continuidad e impulsar la expansión operativa.

6. Mantenimiento proactivo de equipos y dispositivos asociados al servicio:

• Implementar un programa de mantenimiento preventivo y correctivo estructurado de los equipos asociados al servicio, que garantice el funcionamiento óptimo y la prolongación de su vida útil.
• Establecer un proceso de revisión periódica de los equipos, con evaluaciones de rendimiento y estado de los equipos para detectar problemas e identificar posibles mejoras.
• Incorporar herramientas de gestión y monitorización remota activa que faciliten el seguimiento en tiempo real del estado y el rendimiento, y la toma de decisiones sobre la sustitución o mejora de equipos.
• Supervisar la adquisición, instalación y configuración de hardware especializado, como nuevos servidores y estaciones de trabajo del servicio.
• Mantener un inventario digitalizado, accesible y actualizado de todos los dispositivos y equipos, que incluya información sobre usuarios y claves de acceso, para asegurar la disponibilidad y el fácil acceso a los sistemas cuando sea necesario.

El uso de los recursos y servicios del Servicio de Administración de Sistemas y Bioinformática del Instituto de Neurociencias CSIC-UMH está sujeto a las siguientes normas. Todos los usuarios deben conocerlas y cumplirlas para garantizar un uso seguro, eficiente y conforme a la normativa vigente.

1. Comunicaciones y Responsabilidad

1. Todas las consultas, solicitudes de acceso, formaciones o incidencias deberán enviarse por correo electrónico a: bioinformatics@umh.es
2. El Investigador Principal (IP) de cada grupo es responsable del uso adecuado de los recursos y servicios por parte de los miembros de su laboratorio.
3. El acceso a servidores, almacenamiento o formación requiere autorización previa del servicio.
4. Los usuarios del servicio deben estar afiliados al Instituto de Neurociencias o realizar estancias oficiales en él.

2. Seguridad y Acceso

1. Cada usuario debe utilizar exclusivamente su cuenta personal. No está permitido compartir cuentas ni credenciales.
2. Las contraseñas deben ser seguras y únicas; no deben compartirse ni reutilizarse.
3. El acceso a los servidores del servicio está restringido a usuarios autorizados y registrados, previa solicitud y aprobación por parte del servicio.
4. Se prohíbe modificar, copiar o manipular recursos, configuraciones o datos sin permiso explícito.
5. Cualquier incidente de seguridad o sospecha de uso indebido debe ser notificado de inmediato al Servicio de Administración de Sistemas y Bioinformática: bioinformatics@umh.es

3. Uso de los Recursos Computacionales

1. Los servidores del servicio están destinados exclusivamente a análisis de datos y tareas de investigación realizadas en el Instituto de Neurociencias.
2. No está permitido almacenar archivos personales o información ajena a proyectos científicos aprobados.
3. La instalación de software o modificación de configuraciones debe ser realizada o aprobada por el personal del servicio.
4. Los procesos que saturen recursos de manera injustificada o afecten al rendimiento global del sistema podrán ser interrumpidos sin previo aviso.
5. Para el uso de servidores específicos como NeuroServer o MRIServer, es necesario solicitar acceso a bioinformatics@umh.es, con copia al Investigador Principal (IP) del grupo.

4. Almacenamiento y Gestión de Datos

1. El almacenamiento en los servidores debe emplearse solo para datos de investigación.
2. Se recomienda realizar copias de seguridad de los datos críticos en dispositivos externos o soluciones alternativas.
3. No está permitido sobrecargar los sistemas con datos innecesarios o mantener archivos antiguos sin un propósito claro.
4. Los datos podrán ser eliminados por mantenimiento o limpieza periódica tras la notificación correspondiente.

5. Uso del Software y Licencias

1. Los usuarios deben respetar los acuerdos de licencia del software instalado en los servidores del servicio.
2. El uso de software está limitado a tareas de investigación científica aprobadas por el Instituto de Neurociencias.
3. No está permitido ejecutar procesos que afecten negativamente al rendimiento general del sistema o que monopolice recursos de manera injustificada.
4. Cualquier solicitud de instalación de nuevo software deberá enviarse a bioinformatics@umh.es con justificación del uso y requisitos técnicos.

6. Formaciones en Bioinformática

1. Cada formación comenzará puntualmente a la hora acordada:
   – Si un participante llega con más de 10 minutos de retraso, la sesión se iniciará sin esperarle.
   – Si el retraso supera los 30 minutos, se considerará no asistencia y no podrá incorporarse a la sesión.
2. En caso de no poder asistir, se deberá avisar por correo electrónico a bioinformatics@umh.es con al menos 5 días hábiles de antelación, especificando el motivo.
3. Las cancelaciones de última hora (menos de 5 días) solo se aceptarán por causas de fuerza mayor, que deberán justificarse mediante documentación si el servicio lo requiere.
4. Dos o más faltas de asistencia o retrasos reiterados de más de 10 minutos sin justificación en un período de seis meses conllevarán una suspensión de dos meses para solicitar nuevas formaciones.
5. En casos de fuerza mayor, los usuarios podrán presentar una justificación por escrito a bioinformatics@umh.es dentro de los 5 días hábiles posteriores a la sesión para evitar sanciones.

7. Asesoramiento en Análisis Ómicos

1. El servicio ofrece asesoramiento técnico y sesiones de resolución de dudas relacionadas con las formaciones, análisis y diseño experimental. Estas sesiones se realizarán los viernes, previa solicitud mediante correo a bioinformatics@umh.es con al menos 3 días de antelación hábiles, indicando el tema concreto a tratar.
2. Las consultas deben ser específicas, bien definidas y directamente relacionadas con las formaciones o proyectos de investigación aprobados.
3. No se atenderán preguntas generales o no justificadas, para respetar el tiempo y la preparación del personal técnico.
4. Las solicitudes se atenderán por orden de llegada, sujetas a la disponibilidad del servicio.
5. Las consultas que no cumplan los requisitos podrán ser aplazadas o rechazadas, priorizando aquellas que demuestren una preparación adecuada por parte del usuario.

8. Reconocimiento en Producción Científica

1. Todo trabajo, artículo o presentación que se derive del uso de los recursos o asesoramiento del servicio deberá incluir la siguiente mención:
   “Los análisis bioinformáticos se realizaron con el apoyo del Servicio de Administración de Sistemas y Bioinformática del Instituto de Neurociencias CSIC-UMH.”
2. El servicio podrá solicitar a los usuarios un informe de actividad o resultados para su memoria anual.

9. Sanciones y Medidas Correctivas

1. Cualquier uso indebido o incumplimiento de estas normas puede llevar a la suspensión temporal o definitiva del acceso a los recursos del servicio.
2. En casos graves de uso fraudulento, negligente o malintencionado, se podrán tomar medidas disciplinarias adicionales según la normativa del Instituto de Neurociencias, el CSIC y la UMH.

La infraestructura informática común comprende distintos sistemas de altas prestaciones para almacenamiento y procesamiento de datos con software especializado preinstalado. Esta infraestructura incluye tres servidores de alto rendimiento —NeuroServer para análisis de datos ómicos, MRIServer para procesamiento de imágenes de resonancia magnética y Acquifer HIVE para análisis de imágenes de microscopía— junto con cinco estaciones de formación y análisis dedicadas. Estos sistemas están estratégicamente distribuidos entre el IN y el CPD para optimizar el acceso y la gestión de datos en entornos multiusuario.

A continuación, se detallan las especificaciones técnicas de los sistemas principales:

1. NeuroServer (Sistema de Procesamiento de Datos Ómicos)

• CPU: 4x Intel Xeon E7-8870 v4, con un total de 80 núcleos (160 hilos) a 2.10 GHz y 200 MB de caché L3.
• RAM: 2 TB DDR4 ECC registrada a 2400 MHz (operando a 1600 MHz).
• Almacenamiento: 40 TB SSD SATA3 en configuración RAID 5 (10 discos SSD de 4 TB cada uno).
• Almacenamiento NAS: 22.6 TB utilizables, con 8 discos duros HDD SATA3 de 6 TB en RAID 6, más 1 disco de repuesto.

2. MRIServer (Servidor de Análisis de Imagen de Resonancia Magnética)

• CPU: AMD Epyc 9474F, 48 núcleos (96 hilos) a 3.60 GHz con 256 MB de caché L3.
• RAM: 384 GB de memoria DDR5 ECC registrada a 4800 MHz.
• GPU: Nvidia RTX A6000 con 48 GB de memoria GDDR6.
• Almacenamiento: 2 TB SSD NVMe.

3. Acquifer HIVE (Servidor de Análisis de Imagen de Microscopía)

• CPU: Intel Xeon Platinum 8280, 28 núcleos (56 hilos) a 2.70 GHz con 28.5 MB de caché L3.
• RAM: 1 TB de memoria DDR4 registrada a 3200 MHz.
• GPU: Nvidia RTX 5000 con 48 GB de memoria GDDR6.
• Almacenamiento: 10 TB SSD NVMe.
• Almacenamiento NAS: 78 TB utilizables, con 15 discos duros HDD SATA3 de 6 TB en RAID 6.

4. Estaciones de Análisis (5 unidades)

• CPU: Intel Core i5-13400, 10 núcleos (16 hilos) a 2.50 GHz con 20 MB de caché L3.
• RAM: 64 GB de memoria DDR4 a 3200 MHz.
• GPU: Nvidia RTX 3050 con 6 GB de memoria GDDR6.
• Almacenamiento: 500 GB SSD NVMe y 4 TB HDD SATA3.

Esta infraestructura proporciona una base robusta y eficiente para el procesamiento y análisis de datos científicos, que optimiza el rendimiento en el ámbito de la investigación en nuestro centro.

Las comunicaciones generales, consultas y solicitudes se realizarán preferentemente por correo electrónico a: bioinformatics@umh.es

Dirección:

Coordinación científica:
José Pascual López-Atalaya
Teléfono: +34 965 23 37 44
Email: jose.lopez@umh.es

Administración de Sistemas y Bioinformática

Planta baja – Despacho 018, derecha – Estancias S08P0003 y S08P0004
Instituto de Neurociencias, Universidad Miguel Hernández–CSIC
Campus de San Juan, Sant Joan d’Alacant, Alicante | España
Tel. + 34 965 23 37 00 (ext. servicio 9256)